MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 1605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	TTC	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795334
2	NC_004838	TTC	2	6	798	803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795334
3	NC_004838	AAC	2	6	807	812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795334
4	NC_004838	GAT	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795334
5	NC_004838	TCC	2	6	823	828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795334
6	NC_004838	TTC	2	6	867	872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795334
7	NC_004838	TGG	2	6	888	893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795334
8	NC_004838	GCC	2	6	914	919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795334
9	NC_004838	GAT	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795334
10	NC_004838	GCT	2	6	992	997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795334
11	NC_004838	GTTAA	2	10	1042	1051	40 %	40 %	20 %	0 %	31795334
12	NC_004838	AGA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795334
13	NC_004838	TCA	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795334
14	NC_004838	CGA	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795334
15	NC_004838	CAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795334
16	NC_004838	GAT	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795334
17	NC_004838	TATCCA	2	12	1496	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795334
18	NC_004838	CAG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795334
19	NC_004838	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795334
20	NC_004838	AAC	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795334
21	NC_004838	ACGC	2	8	2537	2544	25 %	0 %	25 %	50 %	31795335
22	NC_004838	AACA	2	8	2601	2608	75 %	0 %	0 %	25 %	31795335
23	NC_004838	ACG	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795335
24	NC_004838	TACGT	2	10	2713	2722	20 %	40 %	20 %	20 %	31795335
25	NC_004838	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795335
26	NC_004838	ATC	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795335
27	NC_004838	CGCTC	2	10	2779	2788	0 %	20 %	20 %	60 %	31795335
28	NC_004838	ATC	2	6	2859	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795335
29	NC_004838	TGC	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795335
30	NC_004838	GA	3	6	2953	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	31795335
31	NC_004838	ACG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795335
32	NC_004838	GCG	2	6	3267	3272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39980765
33	NC_004838	ACGA	2	8	3301	3308	50 %	0 %	25 %	25 %	39980765
34	NC_004838	GA	4	8	3381	3388	50 %	0 %	50 %	0 %	39980765
35	NC_004838	CTTG	2	8	3544	3551	0 %	50 %	25 %	25 %	31795336
36	NC_004838	ATA	2	6	3572	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795336
37	NC_004838	ATA	2	6	3587	3592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795336
38	NC_004838	T	6	6	3654	3659	0 %	100 %	0 %	0 %	31795336
39	NC_004838	AGC	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795336
40	NC_004838	CCG	2	6	3736	3741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795336
41	NC_004838	TCT	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795336
42	NC_004838	CTT	2	6	3778	3783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795336
43	NC_004838	GCC	2	6	3864	3869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795336
44	NC_004838	TTTC	2	8	3946	3953	0 %	75 %	0 %	25 %	31795336
45	NC_004838	CAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795336
46	NC_004838	AAG	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795336
47	NC_004838	CAG	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795336
48	NC_004838	GT	3	6	4348	4353	0 %	50 %	50 %	0 %	31795336
49	NC_004838	T	6	6	4377	4382	0 %	100 %	0 %	0 %	31795336
50	NC_004838	CAGG	2	8	4414	4421	25 %	0 %	50 %	25 %	31795336
51	NC_004838	C	7	7	4427	4433	0 %	0 %	0 %	100 %	31795336
52	NC_004838	CCG	2	6	4486	4491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795336
53	NC_004838	ATA	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795336
54	NC_004838	A	7	7	4591	4597	100 %	0 %	0 %	0 %	31795337
55	NC_004838	ATA	2	6	4607	4612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795337
56	NC_004838	ATAAGC	2	12	4671	4682	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	31795337
57	NC_004838	ATC	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795338
58	NC_004838	ACA	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795338
59	NC_004838	AAG	2	6	5083	5088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795338
60	NC_004838	TGG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795338
61	NC_004838	GTG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795338
62	NC_004838	ATC	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795338
63	NC_004838	CT	3	6	5300	5305	0 %	50 %	0 %	50 %	31795338
64	NC_004838	CAA	2	6	5483	5488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795338
65	NC_004838	TGT	3	9	5554	5562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795338
66	NC_004838	ACCACA	2	12	5572	5583	50 %	0 %	0 %	50 %	31795338
67	NC_004838	AAG	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795338
68	NC_004838	TGC	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795338
69	NC_004838	GGT	2	6	5600	5605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795338
70	NC_004838	GCTG	2	8	5651	5658	0 %	25 %	50 %	25 %	31795338
71	NC_004838	CACC	2	8	5690	5697	25 %	0 %	0 %	75 %	31795338
72	NC_004838	GTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795338
73	NC_004838	GAA	2	6	5799	5804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795338
74	NC_004838	GTC	2	6	5850	5855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795338
75	NC_004838	GAT	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795338
76	NC_004838	GGC	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795338
77	NC_004838	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795340
78	NC_004838	GAC	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795340
79	NC_004838	A	7	7	6509	6515	100 %	0 %	0 %	0 %	31795340
80	NC_004838	CAT	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795340
81	NC_004838	AC	3	6	6644	6649	50 %	0 %	0 %	50 %	31795340
82	NC_004838	GAA	2	6	6778	6783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
83	NC_004838	CGCA	2	8	6849	6856	25 %	0 %	25 %	50 %	31795340
84	NC_004838	GGC	2	6	6924	6929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795340
85	NC_004838	TGGC	2	8	6995	7002	0 %	25 %	50 %	25 %	31795340
86	NC_004838	TCGC	2	8	7038	7045	0 %	25 %	25 %	50 %	31795340
87	NC_004838	AGA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
88	NC_004838	CTG	2	6	7129	7134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795340
89	NC_004838	GCTC	2	8	7213	7220	0 %	25 %	25 %	50 %	31795340
90	NC_004838	AGA	2	6	7236	7241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
91	NC_004838	GAA	2	6	7294	7299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
92	NC_004838	ATC	2	6	7459	7464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795340
93	NC_004838	TGG	2	6	7541	7546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795340
94	NC_004838	TTA	2	6	7604	7609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795340
95	NC_004838	GTTC	2	8	7735	7742	0 %	50 %	25 %	25 %	31795340
96	NC_004838	GAA	2	6	7851	7856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
97	NC_004838	TGG	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795340
98	NC_004838	CT	3	6	7962	7967	0 %	50 %	0 %	50 %	31795340
99	NC_004838	GAC	2	6	8035	8040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795340
100	NC_004838	TGA	2	6	8111	8116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795340
101	NC_004838	CGCA	2	8	8207	8214	25 %	0 %	25 %	50 %	31795341
102	NC_004838	ACC	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795341
103	NC_004838	AGC	2	6	8275	8280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795341
104	NC_004838	GAC	2	6	8318	8323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795341
105	NC_004838	TGT	2	6	8346	8351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795341
106	NC_004838	CAATG	2	10	8515	8524	40 %	20 %	20 %	20 %	31795341
107	NC_004838	ACGC	2	8	8571	8578	25 %	0 %	25 %	50 %	31795341
108	NC_004838	TGC	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795341
109	NC_004838	GAG	2	6	8678	8683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795341
110	NC_004838	TTA	2	6	8700	8705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795341
111	NC_004838	TTC	2	6	8709	8714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795341
112	NC_004838	CAT	2	6	8764	8769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795341
113	NC_004838	TGAT	2	8	8793	8800	25 %	50 %	25 %	0 %	31795341
114	NC_004838	TGC	2	6	8809	8814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795341
115	NC_004838	TGT	2	6	8842	8847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795341
116	NC_004838	GCC	2	6	8863	8868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795341
117	NC_004838	A	6	6	8943	8948	100 %	0 %	0 %	0 %	31795342
118	NC_004838	TGG	2	6	9060	9065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795342
119	NC_004838	TGG	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795342
120	NC_004838	CAA	2	6	9082	9087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795342
121	NC_004838	CGA	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795342
122	NC_004838	CGC	2	6	9119	9124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795342
123	NC_004838	CCAGT	2	10	9202	9211	20 %	20 %	20 %	40 %	31795342
124	NC_004838	GCGT	2	8	9251	9258	0 %	25 %	50 %	25 %	31795342
125	NC_004838	GAAG	2	8	9328	9335	50 %	0 %	50 %	0 %	31795342
126	NC_004838	AGC	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795342
127	NC_004838	GCAA	2	8	9387	9394	50 %	0 %	25 %	25 %	31795342
128	NC_004838	CAA	2	6	9700	9705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795343
129	NC_004838	TG	3	6	9897	9902	0 %	50 %	50 %	0 %	31795343
130	NC_004838	GTAA	2	8	10177	10184	50 %	25 %	25 %	0 %	31795343
131	NC_004838	GGA	2	6	10371	10376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39980766
132	NC_004838	CTT	2	6	10506	10511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39980766
133	NC_004838	TGA	2	6	10610	10615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39980766
134	NC_004838	TGG	2	6	10686	10691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795345
135	NC_004838	AAC	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795345
136	NC_004838	CCA	2	6	10779	10784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795345
137	NC_004838	CAA	2	6	10836	10841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795345
138	NC_004838	CAG	2	6	11000	11005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795346
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142	NC_004838	AGGGG	2	10	11355	11364	20 %	0 %	80 %	0 %	31795347
143	NC_004838	CTTT	2	8	11377	11384	0 %	75 %	0 %	25 %	31795347
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265	NC_004838	CTG	2	6	19282	19287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795358
266	NC_004838	ACAA	2	8	19364	19371	75 %	0 %	0 %	25 %	31795359
267	NC_004838	CAT	2	6	19377	19382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795359
268	NC_004838	GCT	2	6	19434	19439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795359
269	NC_004838	TGC	2	6	19445	19450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795359
270	NC_004838	TGG	2	6	19511	19516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795359
271	NC_004838	GCC	2	6	19529	19534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795359
272	NC_004838	ACC	2	6	19553	19558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795359
273	NC_004838	CGAAG	2	10	19872	19881	40 %	0 %	40 %	20 %	31795360
274	NC_004838	AC	3	6	19898	19903	50 %	0 %	0 %	50 %	31795360
275	NC_004838	GGA	2	6	19914	19919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795360
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279	NC_004838	TCGG	2	8	20105	20112	0 %	25 %	50 %	25 %	31795360
280	NC_004838	AAG	2	6	20140	20145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795360
281	NC_004838	TCG	2	6	20230	20235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795360
282	NC_004838	GAC	2	6	20269	20274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795360
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285	NC_004838	TGA	2	6	20430	20435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795360
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288	NC_004838	GT	3	6	20541	20546	0 %	50 %	50 %	0 %	31795361
289	NC_004838	CCA	2	6	20584	20589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795361
290	NC_004838	CG	3	6	20595	20600	0 %	0 %	50 %	50 %	31795361
291	NC_004838	AGA	2	6	20611	20616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795361
292	NC_004838	GAA	2	6	20744	20749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795361
293	NC_004838	GTG	2	6	20797	20802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795361
294	NC_004838	GCACT	2	10	20805	20814	20 %	20 %	20 %	40 %	31795361
295	NC_004838	ATC	2	6	20907	20912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795361
296	NC_004838	GCG	2	6	21051	21056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795361
297	NC_004838	TAC	2	6	21129	21134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795361
298	NC_004838	GCAGCC	2	12	21239	21250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	31795361
299	NC_004838	GT	3	6	21309	21314	0 %	50 %	50 %	0 %	31795361
300	NC_004838	GCAC	2	8	21392	21399	25 %	0 %	25 %	50 %	31795361
301	NC_004838	GCG	2	6	21400	21405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795361
302	NC_004838	AT	3	6	21418	21423	50 %	50 %	0 %	0 %	31795361
303	NC_004838	TCC	2	6	21439	21444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795361
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312	NC_004838	GGCG	2	8	21849	21856	0 %	0 %	75 %	25 %	31795362
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342	NC_004838	CT	3	6	23000	23005	0 %	50 %	0 %	50 %	31795362
343	NC_004838	CTGA	2	8	23040	23047	25 %	25 %	25 %	25 %	31795362
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377	NC_004838	AGCA	2	8	24948	24955	50 %	0 %	25 %	25 %	31795364
378	NC_004838	CTGC	2	8	24960	24967	0 %	25 %	25 %	50 %	31795364
379	NC_004838	GGC	2	6	25003	25008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795364
380	NC_004838	GTT	2	6	25024	25029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795364
381	NC_004838	CT	3	6	25089	25094	0 %	50 %	0 %	50 %	31795364
382	NC_004838	CGC	2	6	25119	25124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795364
383	NC_004838	TGCCG	2	10	25281	25290	0 %	20 %	40 %	40 %	31795365
384	NC_004838	GAGC	2	8	25322	25329	25 %	0 %	50 %	25 %	31795365
385	NC_004838	CAG	2	6	25332	25337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795365
386	NC_004838	ATC	2	6	25339	25344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795365
387	NC_004838	GCTT	2	8	25350	25357	0 %	50 %	25 %	25 %	31795365
388	NC_004838	CCGT	2	8	25404	25411	0 %	25 %	25 %	50 %	31795365
389	NC_004838	TGG	2	6	25414	25419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795365
390	NC_004838	ATTC	2	8	25468	25475	25 %	50 %	0 %	25 %	31795365
391	NC_004838	CCGTAA	2	12	25630	25641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31795365
392	NC_004838	A	6	6	25719	25724	100 %	0 %	0 %	0 %	31795365
393	NC_004838	GCA	2	6	25866	25871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795365
394	NC_004838	GAA	3	9	25919	25927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795366
395	NC_004838	CAG	2	6	26041	26046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795366
396	NC_004838	CAG	2	6	26112	26117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795366
397	NC_004838	GAC	2	6	26137	26142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795366
398	NC_004838	CGG	2	6	26153	26158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795366
399	NC_004838	GAA	2	6	26230	26235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795366
400	NC_004838	TGGCGC	2	12	26459	26470	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31795367
401	NC_004838	ATC	2	6	26472	26477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795367
402	NC_004838	TGTCG	2	10	26528	26537	0 %	40 %	40 %	20 %	31795367
403	NC_004838	CCA	2	6	26782	26787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795367
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432	NC_004838	TGA	2	6	28967	28972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795371
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482	NC_004838	TGG	2	6	31605	31610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
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